这首诗描绘了诗人夜宿荒店，独对孤月，内心充满复杂情感的场景。首句“孤疢锢南山”以“孤疢”比喻内心的痛苦，仿佛被囚禁在深山之中，暗示了诗人内心的孤独与挣扎。接着，“行行近天阙”则可能象征着诗人追求理想或目标的过程，虽然接近但似乎仍遥不可及。

“解鞍荒店小，回视白日没”描述了诗人卸下疲惫，暂时休息的场景，但回头望见太阳已落，时间流逝，不免让人感到时光易逝，岁月匆匆。接下来，“苍天何肺肝，露下百草歇”表达了诗人对自然界的感慨，苍天如同有肺有肝，露水落下，百草凋零，展现出自然界生命的短暂与脆弱。

“披衣梦不成，颠倒一孤月”写出了诗人难以入眠，只能对着孤月沉思的情景，内心的孤独与外界的寂静形成鲜明对比。而“下阶逢此花，骚魂惊醉兀”则描绘了一朵在霜中顽强生长的菊花，触动了诗人的心灵，让他的思绪从孤独中抽离，感受到生命的力量和坚韧。

最后，“相遇定何心，霜底一枝活”表达了诗人对这朵菊花的深刻感悟，无论是何种心境，生命总能找到生存的方式。“欲采不得遗，惆怅至明发”则流露出诗人对这朵花的欣赏与不舍，以及对美好事物即将消逝的无奈与惋惜。“敢苦尘沙黄，哀愚天可达”则是诗人对生活的态度，即使面对困难与挫折，也要保持坚韧不拔的精神，向天表达自己的哀伤与决心。

整体而言，这首诗通过细腻的描写和深刻的思考，展现了诗人对生命、自然、孤独与希望的深刻洞察，以及在逆境中寻找光明与力量的决心。